PE保护膜和PET保护膜是两种不同的材质，各有其特点和适用场景，因此无法简单地说哪个更好，而应根据具体需求和应用场景做出选择。

PE保护膜是聚乙烯材料制成的保护膜，具有柔软、廉价、易于加工和成型的特点。它适用于一些对保护膜要求不高的应用场景，如临时包装、物流运输过程中的表面保护等。

PET保护膜是聚酯类材料（聚对苯二甲酸乙二醇酯）制成的保护膜，具有优异的透明度、耐磨性、抗刮擦性和高温耐性。它常用于高要求的应用场景，如电子产品、光学仪器、汽车仪表盘等需要保护屏幕或表面的领域。

因此，选择PE保护膜还是PET保护膜需要根据具体的应用需求来判断。如果需要更高的透明度、耐磨性和抗刮擦性能，以及在高温环境下使用的要求，PET保护膜可能更适合。如果对保护膜的性能要求相对较低，并且成本和加工方面更为关注，PE保护膜可能是一个更经济实惠的选择。